传染性软疣治疗时可以采用外治法，比如可以将损害中的软疣小体用小镊子夹出或挑出，也可以用刮匙刮除。此外，传染性软疣还可采用电干燥治疗的方法，或者是液氮、干冰冷冻去除的方法。对于巨大的疣还可采用手术切除的治疗方法。
传染性软疣注意事项
1、坚决杜绝性乱：传染性软疣患者中60%是通过性接触染病地。家庭中一方从社会上染病，又通过生活传染配偶，还有可能通过密切地生活接触传给家中其他人，既带来了生理上的痛苦，又造成家庭不和，背负精神压力。因此提高性道德，不发生婚外性行为是预防传染性软疣发生地重要方面。
2、防止接触传染：不使用别人的内衣、泳装及浴盆；在公共浴池不洗盆塘，提倡淋浴，沐浴后不直接坐在浴池的坐椅上；在公共厕所尽量使用蹲式马桶；上厕所前用肥皂洗手；不在密度大、消毒不严格地游泳池游泳。
日常在治疗传染性软疣的时候，病人要注意调整好自己的心态。不要整天因为这一疾病而影响到工作效率和日常正常生活的开展。有传染性软疣症状的话，平时就要注意卫生，餐具单独使用就好，切不可与别人一起使用私人东西。