一般而言，造成新生仔猫死亡的原因不外乎下列几个原因：先天异常、营养问题（母猫及仔猫）、出生体重过低、生产时或生产后的创伤（难产、食子癖、母猫因疏忽而造成伤害）、新生儿溶血、传染病，及其他各种早夭原因。
一、先天异常
先天异常指的是仔猫于出生时即可发现的异常状态，大部分都由于基因的问题所引起，当然，也有许多的外在因子也可引起畸胎，如X 光，或某些药物。特别是那些包含中枢神经系统、心脏血管系统、呼吸系统的先天异常，其他的先天异常可能直到小猫能完全自主行动时才被注意到，通常是在预防注射前的健康检查才被兽医师所发现，或者造成明显地影响时，或发现仔猫的成长迟滞时。
解剖上的异常包括：颚裂、头盖骨缺陷、小肠或大肠发育不全、心脏畸型、过度的肚脐、泌尿道畸型、及肌肉骨骼畸型，一些显微解剖上及生物化学上的异常通常无法加以诊断，并可能被归类于其他的原因，或者不明原因的死亡。
二、畸胎作用
已有许多的药物及化学物质被认为具有导致畸胎作用，并有完整的报告，会造成仔猫的先天异常及早夭，因此，于怀孕期间应避免给予任何的药物及化学物质特别是类固醇及灰微素（治疗微菌用的口服药）。
三、营养问题
怀孕母猫喂予不适当的食物可能会造成生出虚弱或疾病的仔猫，近十年来被认为最严重的营养问题就是牛胆素的缺乏，已知会引起胎儿重吸收、流产、死产、及发育不良的仔猫。引起新生仔猫营养不良的原因包括：母体严重营养不良、胎儿时缺乏适当的母体血液供应，及胎盘空间的竞争。
四、体重不足
出生时的体重不足往往会造成较高的仔猫死亡率，新生仔猫的出生体重应该不受性别、胎数、及母猫体重所影响。引起出生体重不足的原因尚未明了，但必定包含许多因素。虽出生体重不足常被归因于早产，但大部分的临床病例则多为足期生产，可能是由于先天异常或营养因素所引起。
出生体重不足不仅有较高的死产及早夭的可能性（六周龄内），并且可能引起某些小猫变成慢性发育不良，于幼猫期内死亡，因此仔猫应于出生时秤重，并定期测量，直到小猫到达六周龄时。
五、创伤
创伤所引起的生产时或出生后5日内的仔猫死亡，大多与难产、食子癖、或母性不良有关。食子癖大多发生于神经质或高度敏感的母猫，但是，母猫将生病的新生仔猫吃食掉是相当常见的，不能将所有母猫的食子行为归罪于食子癖，这样的食子行为是为了其他健康的仔猫，避免它们受到可能的疾病感染，并且可以减少无谓的照料及母乳消耗。母猫通常对于生病的新生仔猫不会加以理睬及照料，甚至会将其叼出窝巢或推出笼外，这种行为很难与母性不良加以区别。
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