这段时间也是具有传染性的，但机率会比有尖锐湿疣临床表现时低。
如果不确定是不是潜伏期的话，可以做详细检查来判断：
1、组织化学检查：取少量病损组织制成涂片，用特异抗人类乳头瘤病毒的抗体作染色。如病损中有病毒抗原，则抗原抗体结合。在过氧化物酶抗过氧化物酶(PAP、方法中，核可被染成红色。此法特异性强且较迅速，对诊断有帮助。
2、病毒疣抗体试验：迄今，HPV难于用传统的病毒培养及血清学技术检测，主要实验诊断技术是核酸杂交。近年来发展的PCR方法具有特异、敏感、简便、快速等优点，为HPV检测开辟了新途径。
3、病理检查：病理检查在尖锐湿疣检查中，属于准确度很高的一种方法。它从尖锐湿疣的症状着手，通过检查来判定是否为尖锐湿疣。病理检查主要为角化不全，棘层高度肥厚，乳头瘤样增生，表皮突增厚，延长，其增生程度可似假性上皮瘤样。
4、免疫组织学检查：常用过氧化物酶抗过氧化物酶方法(即PAP显示湿疣内的病毒蛋白，以证明疣损害中有病毒抗原。HPV蛋白阳性时，尖锐湿疣的浅表上皮细胞内可出现淡红色的弱阳性反应，假性尖锐湿疣则不会。