事实上，体内完全没有细菌，呈现无菌状态的动物，和体内有许多细菌的普通动物相较，免疫力会比较脆弱。这是因为无菌的动物体内缺乏细菌的刺激，环境过于平和，所以体内的免疫力降低所致。当无菌动物的肠内有细菌栖息之时，也会对各种病原菌产生抵抗力。
我爱好菌，我怕坏菌
双叉杆菌和乳酸菌等好菌会分泌出一种液体，该分泌液一经作用，便会在肠内合成维他命，帮助消化及吸收。
当坏菌侵入人体时，好菌也会负起保护身体之责，抑制肠内坏菌的繁殖，提高免疫力，使人体免受病菌的感染。
坏菌会分解被送入肠内的食物，产生氨和硫化氢等对人体有害的物质及毒素，这些有害物质会随着血液循环至全身各处，成为发病的主因。
所以，健康的第一步就是——抑制坏菌的作用，赋予好菌活性，也就是保持肠内正常状态。
如果肠内处于正常状态，好菌便能发挥效力，大量分泌液体，这些分泌物随着血液遍布全身各处，赋予细胞活性，形成健康的身体。
乳酸菌分泌物会随着血液流经身体各处，深入到肌肉、神经和皮肤，给全身上下的每一个细胞活力。原本衰弱、受伤的细胞，会因此恢复健康，身体的各种不适症状也会获得改善。
好菌哪里来?
乳酸菌是相当庞杂的菌群，为能利用碳水化合物进行酦酵产生多量乳酸之细菌的总称。不同种类的细菌作用和生存场所有别。生存于人体内的乳酸菌有双叉菌、嗜酸乳杆菌及一种肠球菌，这些都是具有积极作用的好菌。
乳酸菌用糖生产乳酸的过程叫做“乳酸发酵”。乳酸菌利用乳酸发酵酿造以优酪乳为主的发酵食品。如奶酪、意大利式腊肠、发酵黄油、优酪乳油、黑麦面包、豆瓣、酱油、碱菜等。
其次，乳酸菌还具有延长食品保存期的作用。因为有酸，食品呈酸性，可有效地防止腐败菌和病原菌的增加。优酪乳的保存期比牛奶的长，就是因为这个原因。
此外，由于乳酸菌发酵，食物变得易消化、吸收。喝牛奶后肚子胀气的人也可放心地喝优酪乳。
通常将二、三种这类种菌配合使用。这样可有效利用各种菌的特性所产生的综合作用，提高彼此的乳酸发酵效果，并且可在短时间内生产出优酪乳。
坏菌哪里来?
具代表性的坏菌是大肠菌以及威尔斯菌。这些细菌非常喜欢蛋白质。当我们吃了鱼、肉等蛋白质含量丰富的食品之后，有部份的蛋白质会在肠内形成阿摩尼亚、胺、硫化氢等有害物质。这些有害物质会诱发下痢、肠炎、使血压变动，造成疾病以及老化的原因，甚至诱发癌症。
好菌与坏菌的消长
肠内细菌的英文原名是花田的意思，换言之，肠内的好菌与坏菌就像是井然有序的花田一样，形成一个秩序非常良好的社会。
肠子内细菌栖息的空间是一定的，所以，基本上，如果坏菌增加，那么好菌就会减少，好菌增加的话，坏菌就会减少。从我们出生到死亡，我们的肠子内好菌及坏菌就不断进行势力争夺战。这关系有如警察(好菌)与流氓(坏菌)，警察多流氓就少，警察少了流氓就嚣张。
这场抗争的结果，对于宿主——人体有直接影响。
因此，如何使好菌在我们的体内占优势，这是左右我们身体健康的重点。
肠内坏菌多，怪谁?
所谓的坏菌，其实也是肠道内正常菌丛的一员，在好菌的管制下会维持在一定数量以下，对人体不会有不良的影响。
但当肠道内的菌丛生态改变，好菌的数量减少，坏菌就会坐大。坏菌数目增大到一定程度，其产生的有害物质就足以对人体产生负面作用，前述种种不适的现象就会出现。
平时不注重养生、偏食、压力、睡眠不足等不良生活习惯，在在都会造成人体肠道内菌丛生态的改变，而导致身体的状况恶化。换言之，任由肠内好菌的居住环境恶化，使其有利于坏菌的增生，甚至引发疾病，自己要负大部分的责任。
癌症的主因是饮食
现代的食物虽多名为天然食品，但追根究底还是以人工、加工食品居多。像蔬菜、水果等多来自使用化学肥料的无机农业，鸡鸭鱼肉等也多是人工饲育的肉类食物，尤其我们食用的肉类动物，只是被喂食水和配合饲料，而且将它们关在少见阳光的环境里饲养。
问题也因此滋生了，为了预防动物感染疾病及细菌，配合饲料中添加了很多抗生素及荷尔蒙剂，我们平日所食用的动物吃了这些饲料后，对我们的身体也会有直接的不良影响。
绝大多数的养殖鱼，都会喂食合成荷尔蒙以促进成长，并添加防腐剂与抗生素。
要将残留在农产品中的农药、蔬菜和水果中的化学物质完全去除，其实是不可能的事。
我们虽然注意营养，也按照均衡的原则来摄取食物，但是实际上，我们所吃的食物本身就是有害身体健康的物质。
另外，加工食品所带来的后遗症，也不容忽视。
美式饮食的特征是蛋白质以及脂肪含量很高，纤维比较少。美式饮食的第一个弊害就是便秘。如果粪便无法定期排泄，长期停留在肠内，那么肠内就会变成坏菌的温床。所以，当坏菌最喜欢吃的蛋白质不断的送进来时，坏菌就会不断的繁殖。
换言之，丰富的饮食生活提供了坏菌良好的生活环境，使其势力坐大。
肠内的坏菌不断增加，一旦打败了好菌之后，增加速度会变得很惊人，制造出阿摩尼亚、硫化氢、胺、苯酚、蚓垛等等有害物质。事实上坏菌所产生的这些有害物质都和癌症的形成脱不了关系。
坏菌多大便黑臭——好菌让肠内更干净
乳酸菌分解糖所生产的乳酸和醋酸，具有使肠内呈酸性，抑制腐败菌和病原菌繁殖的作用。
观察大变的颜色即可判断肠内是否呈酸性。
使血液呈红色的血色素在肝脏被分解，形成叫做胆红素的色素，和胆汁一起被分泌。胆红素因酸度而改变颜色，呈碱性时为绿褐色，呈酸性时为黄色或橙色，但由于肠内细菌的作用而变成黄褐色或褐色。
肠内呈酸性时大便的颜色为黄褐色，随着碱性增大，粪便的褐色加深变浓。便秘时大便呈深褐色且恶臭，是由于肠内腐败菌大肆活动，双叉菌等乳酸菌减少，肠内呈碱性造成的。
用母乳哺育的婴儿的肠中双叉菌占95%左右，因此大便的颜色呈黄色。若成人的大便也像婴儿的大便那样呈黄色，则为最理想的状态。