在患了真菌性尿道炎的时候，出现的症状和其它类型的尿道炎非常类似，比如尿频、尿急以及尿痛等，而且患者的尿道口会出现一些分泌物。由于真菌的增值扩增能力要比其它细菌弱一些，所以病情的发展不是很快。
真菌性尿道炎引起的症状大多都不会很严重，患者一般会感到尿道有一些灼热、刺痛感。对于不太严重的真菌性尿道炎，可以口服一些抗真菌类的药物来治疗。不过所需的治疗时间是比较长的，通常都需要服药一个月左右，而且还可能会更久。
在治疗真菌性尿道的时候，患者可以在服用药物的同时，再采取一些其他的治疗方法，比如物理疗法。可以通过微波治疗、激光治疗和紫外线照射等手段，来对真菌性尿道炎进行治疗，这也有出色的杀菌消毒作用，而且还有助于提高患者尿道的抗菌能力。